Hlavným poslaním a cieľom agentúry je:

-       presadzovať a hájiť záujmy regionálnej politiky Slovenskej republiky

-       iniciovanie a riadenie strategických rozvojových plánov v regióne

-       podporovanie efektívnej spolupráce v ekonomickom, kultúrnom a sociálnom rozvoji medzi samosprávou, štátnou správou, podnikateľmi a tretím sektorom

-       podpora spolupráce verejnej a súkromnej sféry

-       propagácia regiónu a jeho potenciálu tak v rámci regiónu, ako aj na národnej a medzinárodnej úrovni, podpora dovozu a vývozu

-       podpora prísunu investícii do regiónu

-       poradenská činnosť vo veci rozvoja, koordinácie a manažovania rozvojových projektov

-       obnova miest a obcí špeciálne s ohľadom na rozvoj a budovanie infraštruktúry regiónu

-       vyvíjanie agentúrnej činnosti, poskytovanie informačných služieb, vzdelávacej, poradenskej, tlmočníckej a prekladateľskej činnosti

-       vyvíjanie sprostredkovateľskej činnosti

-       vyvíjanie a koordinácia aktivít  súvisiacich s rozvojom regiónu

-       získavať a využívať tuzemské a zahraničné finančné zdroje pre regionálny rozvoj

-       vykonávať vlastnú hospodársku činnosť na podporu riadneho plnenia svojich úloh a v súlade so svojim poslaním

-       realizovať regionálny informačný systém ako obslužný servis pre regionálnu správu, podnikateľské subjekty a širokú verejnosť

-       spolupracovať v rámci cezhraničnej spolupráce s agentúrami podobného zamerania v krajinách Európskej únie

Medzi hlavné priority sledované agentúrou patrí:

-       integrovaný rozvoj miest a vidieka v definovanom regióne

-       dlhodobé a koncepčné rozvíjanie  stredného a malého podnikania

-       zamestnanosť v rámci regiónu

-       rozvíjanie verejno-súkromného partnerstva

-       transparentnosť finančných tokov a zdrojov